Isı eşanjörü contaları farklı özelliklere sahip çeşitli malzemelerden yapılır. Kauçuk gibi genel conta malzemeleri iyi bir esnekliğe sahip olup, ısı eşanjörünün çalışması sırasında sıcaklık ve basınç değişikliklerine uyum sağlamalarına, arayüzü etkili bir şekilde sızdırmaz hale getirmelerine ve ortam sızıntısını önlemelerine olanak tanır. Kauçuk contalar aynı zamanda belirli bir derecede korozyon direncine de sahiptir; asitler ve alkaliler gibi yaygın olarak kullanılan aşındırıcı ortamlara karşı bir miktar direnç sunar ve böylece ısı eşanjörünün servis ömrünü uzatır.
Öte yandan asbest contalar yüksek-sıcaklık direncine sahiptir, yüksek-sıcaklık ortamlarında istikrarlı performansı korur ve kolayca yumuşamaz veya erimez, bu da ısı eşanjörünün yüksek-sıcaklık koşulları altında normal çalışmasını sağlar. Ancak asbestin potansiyel sağlık tehlikeleri nedeniyle son yıllarda yavaş yavaş yerini diğer çevre dostu malzemeler almaya başlamıştır.
Politetrafloroetilen (PTFE) contalar son derece düşük bir sürtünme katsayısına sahiptir, bu da ısı eşanjörlerindeki sızdırmazlık yüzeylerindeki aşınmayı azaltarak çalışma direncini azaltır. Ayrıca güçlü asitler, güçlü alkaliler veya organik çözücüler gibi hemen hemen tüm kimyasallara direnç göstererek iyi bir kimyasal korozyon direncine sahiptirler.
Bakır contalar gibi metal contalar yüksek mukavemete ve ısı iletkenliğine sahip olup, yüksek sıcaklık ve yüksek basınç koşullarında güvenilir sızdırmazlık sağlar. Ayrıca ısı transferine katkıda bulunarak ısı değişim verimliliğini artırırlar.

